Perguntas Base de cálculo PIS/COFINS diferente do valor total dos itens - SPED PIS/COFINS

Pessoal,
Estou precisando fechar o SPED PIS COFINS mas o arquivo não está batendo a base de cálculo do PIS/COFINS com o valor total do item CST 01 que são as saídas.
Já identifiquei a diferença, não está puxando dois cupons do dia 04/07, mas os cupons existem, estão nas tabelas SD2, SF2, SFT, SF3.
Além de não bater os valores da consolidação, se eu marcar MAPA RESUMO igual = Sim (que na visão deveria ser o correto visto que trabalhamos com ECF) eles não saem nos livros os dois cupons do dia 07/04 e dá diferença também nos livros.

Alguém já passou por uma situação semelhante?