Perguntas Calculo Pis/Cofins CT-e

Boa tarde!

Estou com a seguinte situação, no calculo de um CT-e a base de calculo esta a maior do que no documento fiscal, qual o parâmetro na TES que poderia estar afetando isto?

Correto
Valor CT-e R$ 2.571,06
Pis - R$ 42,42
Cofins - R$ 195,40

Incorreto
Base de Calculo R$ 2.921,66(sistema calculando automático)
Pis - R$ 48,21
Cofins - R$ 222,05

A operação não tem ICMS, fiz o calculo por dentro dos impostos e mesmo assim não chego na base que o sistema esta calculando.

Agradeço desde já

Tiago