Perguntas Compensa PA

Estou com o seguinte problema quando eu gero uma NF o sistema gera um titulo de ISS com mesmo numero, tipo NF de 5000,00 com ISS de 500 apos gerar a NF fica 4500,00 e gera um titulo de tipo ISS de 500,00 ai eu gero uma PA de 1000 ao compensar o NF com a PA o saldo da NF fica 3000,00 quando deveria ficar 3500,00.

Aguem sabe o que pode estar rolando, se é coisa de parâmetros.