Perguntas Geração da DIRF - Inconsistência de dados

Bom dia.
Pessoal estamos em processo de implantação do Protheus em nossa empresa.
Este ano ao gerar a DIRF tivemos que fazer mais de 10.000 ajustes na base de dados, pois a entrada de dados foram digitadas de forma errada.
Exemplo código errado para natureza de serviços de 3208 - 1708.
Envio de notas e documentos a pagar que não deveriam compor a DIRF, falta de envio de notas e documentos a pagar que deveriam ir e não foram, enfim.
Ou seja os usuários finais que dão entrada de nota fiscal e contas a pagar nem sempre conhece a parte fiscal e somos também passíveis de erro e esquecimento.

Estão sendo passado para gente alguns pontos de controles como cadastro e parâmetros porém sem sucesso. Uma alternativa deles também foi deixar na entrada de nota fiscal o campo gera dirf = sim e setar automaticamente o código 1708 o que nem sempre é verdade pois o código depende de minha natureza de serviço, e isso não vale para o contas a pagar.

Só temos aqui o Financeiro a parte de pessoal é outro sistema e fazemos a entrada manual.

Eles passaram algum relatório para controle mas muitas das vezes a identificação da entrada de dados errado ocorre após pagamento do DARF dai temos que efetuar a alteração via banco, que não é viável. Visto que a engenharia reversa da operação não traz confiabilidade para abertura dos lançamento e alteração dos mesmos via sistema.

Gostaria de saber se existe cadastros e parâmetros que realmente diminuem
a entrada de informações erradas para a DIRF.
Qual mapeamento precisamos fazer no Protheus para cercar e gerarmos um arquivo txt mais consistente.

No mais obrigada!